依托厦门大学海洋学科优势，坐落于厦门大学马来西亚分校的中国-东盟海洋学院是中国-东盟海上合作基金首批支持建设项目。2014年经外交部和财政部批准启动建设。学院立足马来、面向东盟各国，以传承嘉庚精神、回馈东南亚为己任，促进中国与东盟各国的伙伴关系；以培养海洋专才为核心，秉承“创办一流学科、培育一流人才”的精英教育理念，依托厦门大学90余年办学传统优势，面向东南亚东盟国家之需求，培养高素质、国际化的海洋拔尖创新人才。这也是我国海洋学科第一次走出国门办学。

面向我国海洋强国战略及东盟国家需求，学院将继续增强与东盟各国相关教育科研及海洋事务机构的合作，构建好、发展好海洋研究合作伙伴关系，力争成为亚洲一流、国际上有较大影响的东盟国家海洋人才培养与科技创新基地，中国与东盟国家海洋科教合作交流的基地及东盟地区首屈一指的海洋科技与管理培训基地，为共同建设21世纪“海上丝绸之路”、深入实施海洋发展战略做出突出贡献。